寻找分子差异表达的上游机制（二）

在昨天的内容中，我们从转录因子的角度介绍了如何确定调控基因表达的转录因子，今天我们从microRNA的角度来看。

关于microRNA对靶基因的调控，我们已经写过很多内容了，原理是：microRNA通过结合到靶基因的mRNA上抑制mRNA翻译和降解mRNA来发挥功能，因此microRNA与靶基因的表达是相反的，即microRNA抑制靶基因表达，因此如果我们检测到的靶基因是上调表达的，我们要在下调表达的microRNA中选择。

下面我们以举例来说明，比如这个基因ZHX1是小张从文章中查到的：

这篇plos one说的是转录抑制因子ZHX1在胆管癌样本中显著高表达，并促进胆管癌细胞增殖、侵袭和迁徙。

另外一篇是发表在J Cancer上的文章：

这篇文章说的是ZHX1在胃癌组织中低表达而且抑制胃癌细胞生长，促进细胞周期阻滞和凋亡。

这样就有意思了，大家看到同一个分子ZHX1，在胆管癌和胃癌中的表达相反，一个发挥癌基因功能，一个是抑癌基因功能。所以，大家通过文章找到的分子在自己的疾病中验证的时候如果表达和功能完全相反，也不要怀疑人生，特别是这个分子是发挥广谱作用的分子，比如转录因子、泛素连接酶、翻译因子、酶（比如甲基转移酶DNMT1等等），功能相反的这种现象是普遍存在的，原因有很多种。因为这类分子只是一个工具，发挥什么功能完全看什么人在用，凶手拿枪杀人，军人拿枪保护人，关于这一点的详细论述我们以后展开说。

好了，尽管ZHX1这个分子在胆管癌和胃癌中的功能是完全相反的，ZHX1在胃癌里面低表达发挥抑癌基因这一点是没问题的，如果要从microRNA的角度来阐明其低表达机制该怎么办呢？

这里正好有一篇文章，说的就是microRNA-199a-3p下调ZHX1表达促进胃癌发展。

具体的内容就是小张上次总结过的套路：microRNA研究的几种新模式……

从文章结果来看就是这样：

没错，这个就是套路。

至于从靶基因出发寻找microRNA，这个我们也介绍过：如何从信号通路、疾病查询microRNA和靶基因？，直接用mirwalk来预测就行：

输入ZHX1：

在完整的列表里我们看到mir-199a：

讲完如何从microRNA角度确定对基因ZHX1的调控模式和方法，小张就ZHX1这个分子多说一句：

ZHX1这个分子是个新分子，文章只有26篇，其中5分以上的文章只有1篇，还不是跟它功能直接相关的。所以大家可以围绕这个分子的功能好好研究下，上游结合microRNA，甚至再加上lncRNA作为ceRNA，下游结合ZHX1对基因的转录调控，把功能和机制做全一些。关于ZHX1，至少还有一篇5+的文章，让我们拭目以待！

That's all. Thank you!

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